健改案通過對醫療、製業以及保險等息息相關的產業來說，意味著經營環境將出現翻天覆地的變化。其中醫院、醫生以及製藥公司可望成為大贏家，而保險業將首當其衝受衝擊。

　　對保險業來說，健改一旦落實，行業經營個人及小企業市場的遊戲規則將截然不同。以往這塊盈利甚豐的「肥肉」，日後將受政府密切監管。雖然全民健保可為行業帶來數以千萬計的新客戶，但保險公司將不得以過往病歷為由拒絕受保，在所謂「交易所」出售的個人或小企業保險計劃，其保費差距也不能太大。此外，政府一方面會削減對保險公司的津貼，另一方面又會徵收多種費用。

　　對此，有投資顧問形容，保險業將面對「龐大的商業風險」，預料一些公司無法適應，經營將遇上困難。保險業在回應政府改革時亦表示，健改案如果過關，意味著行業將被迫調高保費，改變現在以昂貴保險計劃之所得，補貼購買了低成本保單、又會提取福利者的做法。

　　相反對醫院和製藥行業來說，健改可說是甚大恩賜。首先在醫院和醫生方面，全民健保意味著數以千萬計的民眾在福利到手後，經濟上更有能力就醫，換言之，接受醫療服務後無力支持費用的病人，數目將大大減少。業界尚需觀察的是，為低入息家庭而設的健保，可容許民眾支付低於成本的醫藥費，這類健保一旦增加，醫院的「虧本客」數目也會上升。但總體而言，醫療界對健改是樂見其成。

　　至於製藥業應是改革的最大贏家。在保險計劃覆蓋下，多了成千上萬的病人就醫，藥物的需求自然會上升，當中可涉及數百億元的利潤。考慮到國會把數家處方藥生產商的獨家經營權延長12年，有關大廠更能獲取巨利。相比下，一般藥物生產商的前景反而較遜色。