61、细胞死亡有多少种形式?

62、是什么保持了细胞内的通行顺畅?

63、为什么细胞的成分可以独立于DNA而自行复制?

64、基因组中功能不同于RNA的角色是什么?

65、基因组中端粒和丝粒的作用是什么?

66、为什么一些基因组很大，另一些又相当紧凑?

67、基因组中的“垃圾”（“junk”）有何作用?

68、新技术能使DNA测序的成本降低多少?

69、器官和整个有机体如何了解停止生长的时间?

70、除了继承突变，基因组如何改变?

71、在胚胎期，不对称现象是如何确定的?

72、翼、鳍和面孔如何发育进化?

73、是什么引发了青春期?

74、干细胞是否位于所有肿瘤的中心?

75、肿瘤更容易通过免疫进行控制吗?

76、肿瘤的控制比治愈是否更容易?

77、炎症是所有慢性疾病的主要原因吗?

78、疯牛病会怎样发展?

79、脊椎动物在多大程度上依赖先天免疫系统来抵抗传染病?

80、对抗原而言，免疫记忆需要延长暴露吗?

81、为什么孕妇的免疫系统不拒绝其胎儿?

82、什么与有机体的生物钟同步?

83、迁徙生物怎样发现其迁移路线?

84、为什么要睡眠?

85、人类为什么会做梦?

86、语言学习为什么存在临界期?

87、信息素影响人类行为吗?

88、一般麻醉剂如何发挥作用?

89、导致精神分裂症的原因是什么?

90、引发孤独症的原因是什么?

91、阿兹海默症患者的生命能够延续多久?

92、致瘾的生物学基础是什么?

93、大脑如何建立道德观念?

94、通过计算机进行学习的极限是什么?

95、有多少个性源于遗传?

96、性别倾向的生物学根源是什么?

97、生命树是生命之间系统关系最好的表达方式吗?

98、地球上有多少物种?

99、什么是物种?

100、横向转移为什么会发生在众多的物种中以及如何发生?

101、谁是世界的共同祖先?

102、植物的花朵如何进化?

103、植物怎样制造细胞壁?

104、如何控制植物生长?

105、为什么所有的植物不能免疫一切疾病?

106、外界压力环境下，植物的变异基础是什么?

107、是什么引起物质消失?

108、能否避免物种消亡?

109、一些恐龙为什么如此庞大?

110、生态系统对全球变暖的反应如何?

111、至今共有多少人种，他们之间有何关联?

112、是什么提升了现代人类的行为?

113、什么是人类文化的根源?

114、语言和音乐演化的根源是什么?

115、什么是人种，人种如何进化?

116、为什么一些国家向前发展，而有些国家的发展停滞?

117、政府高额赤字对国家利益和经济增长速度有什么影响?

118、政治与经济自由密切相关吗?

119、为什么改变撒哈拉地区贫困状态的努力几乎全部失败?

120、有没有简单的方法确定椭圆曲线是否存在无穷多解?

121、霍奇闭链是代数闭链的和吗?

122、数学家将会最终给出Navier-Stokes方程的解吗?

123、庞加莱实验能否确定4维空间的球?

124、黎曼zeta函数的零解都有a+bi形式吗?

125、对粒子物理标准模型研究是否会停止在量子Yang-Mills理论上?

（注：最后6个数学问题选自Clay数学研究所提出的新千年问题）