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《Nature》中的顶级配色,做出来的图太养眼了!(附作图代码)
作者:置身数内 数新社 | 2024/3/28 14:27:10 | 浏览:874 | 评论:0

小数今天给大家分享几组Nature中的配色方案,学学大佬们的图都是怎么配色的。

《Nature》中的顶级配色,做出来的图太养眼了!(附作图代码)

1.配色方案一

《Nature》中的顶级配色,做出来的图太养眼了!(附作图代码)

《Nature》中的顶级配色,做出来的图太养眼了!(附作图代码)

library(tidyverse)


data = readxl::read_xlsx("./data/MOESM21_ESM.xlsx")
data %>%
  pivot_longer(-c(Condition, Lineage),
               names_to = "obs", values_to = "Number of cells")-> df
##Figure01
pal = c("#f9eb77", "#04ced1", "#ed51d0")
ggplot(data = df,
       aes(x=Lineage, y=`Number of cells`))+
  geom_bar(aes(fill = Lineage),
           stat = "summary", fun="mean", color="grey20", width = 0.75)+
  stat_summary(geom = "errorbar", fun.data = "mean_se",
               width=0.25)+
  geom_jitter(width = 0.3, shape=21, color="grey20", fill="white", size=2, stroke=1)+
  scale_x_discrete(limits = c("EPI", "TE", "PrE"))+
  scale_y_continuous(limits = c(0, 300),
                     breaks = seq(0, 300, 100),
                     expand = c(0, 0))+
  scale_fill_manual(values = pal,
                    limits = c("EPI", "TE", "PrE"),
                    guide = "none")+
  guides(y = guide_axis(cap = "upper"))+
  facet_wrap(~Condition, axes = "margins", strip.position = "bottom")+
  theme_classic()+
  theme(strip.placement = "outside",
        strip.background = element_rect(color = NA),
        axis.title.x = element_blank())


2.配色方案二

《Nature》中的顶级配色,做出来的图太养眼了!(附作图代码)

《Nature》中的顶级配色,做出来的图太养眼了!(附作图代码)

pal = c("#e38d8c", "#f1b74e", "#66b0d7")
ggplot(data = df,
       aes(x=Lineage, y=`Number of cells`))+
  geom_bar(aes(fill = Lineage),
           stat = "summary", fun="mean", color="grey20", width = 0.75)+
  stat_summary(geom = "errorbar", fun.data = "mean_se",
               width=0.25)+
  geom_jitter(width = 0.3, shape=21, color="grey20", fill="white", size=2, stroke=1)+
  scale_x_discrete(limits = c("EPI", "TE", "PrE"))+
  scale_y_continuous(limits = c(0, 300),
                     breaks = seq(0, 300, 100),
                     expand = c(0, 0))+
  scale_fill_manual(values = pal,
                    limits = c("EPI", "TE", "PrE"),
                    guide = "none")+
  guides(y = guide_axis(cap = "upper"))+
  facet_wrap(~Condition, axes = "margins", strip.position = "bottom")+
  theme_classic()+
  theme(strip.placement = "outside",
        strip.background = element_rect(color = NA),
        axis.title.x = element_blank())


3.配色方案三

《Nature》中的顶级配色,做出来的图太养眼了!(附作图代码)

《Nature》中的顶级配色,做出来的图太养眼了!(附作图代码)

pal = c("#862a2d", "#468099", "#fcfcfc")
ggplot(data = df,
       aes(x=Lineage, y=`Number of cells`))+
  geom_bar(aes(fill = Lineage),
           stat = "summary", fun="mean", color="grey20", width = 0.75)+
  stat_summary(geom = "errorbar", fun.data = "mean_se",
               width=0.25)+
  geom_jitter(width = 0.3, shape=21, color="grey20", fill="white", size=2, stroke=1)+
  scale_x_discrete(limits = c("EPI", "TE", "PrE"))+
  scale_y_continuous(limits = c(0, 300),
                     breaks = seq(0, 300, 100),
                     expand = c(0, 0))+
  scale_fill_manual(values = pal,
                    limits = c("EPI", "TE", "PrE"),
                    guide = "none")+
  guides(y = guide_axis(cap = "upper"))+
  facet_wrap(~Condition, axes = "margins", strip.position = "bottom")+
  theme_classic()+
  theme(strip.placement = "outside",
        strip.background = element_rect(color = NA),
        axis.title.x = element_blank())


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